Beisen Kubota ist vor allem als Maler und Schüler von Suzuki Hyakunen bekannt. Zusammen mit Kôno Bairei gründete er 1880 die Kyotoer Präfekturschule für Malerei (an der er auch lehrte) und 1890 – erneut mit Bairei – die Kyoto Bijutsu Kyôkai. 1894 trat er in den Dienst der Armee als Illustrator und begleitete die Truppen während des Krieges gegen China in den Jahren 1894/95.
1911 widmete Henry P. Bowie ihm sein Werk „Über die Gesetze der japanischen Malerei“. Gegen Ende seines Lebens erblindete Beisen und starb relativ jung.