Mit achtzehn Jahren begann Tomioka Eisen ein Studium bei Kobayashi Eitaku. Während dieser Zeit arbeitete er neben seiner Tätigkeit als Zeichner im Büro des Generalstabs auch als freischaffender Künstler. Nach Eitakus Tod im Jahr 1890 machte er sich ganz der Kunst zugewandt. Er war sehr erfolgreich und verdiente gut bei den Zeitschriften und Verlagen, für die er arbeitete.
Er strebte danach, als „echter“ Künstler anerkannt zu werden, und gewann eine Silbermedaille bei der ersten gemeinsamen Ausstellung des Japanischen Kunstinstituts und der Japanischen Malervereinigung. Später wurde er Juror bei weiteren Ausstellungen. Kurz vor Beginn seiner Karriere als Maler starb er im Alter von 41 Jahren, als die Kuchi-e-Bewegung noch ihre Blütezeit erlebte.